Outils génomiques de quantification des gènes d'antibiorésistance dans les produits d'élevage de la mouche soldat noire
Description
Nous recherchons une étudiante ou un étudiant motivé pour rejoindre notre équipe dans le cadre d'un projet axé sur le développement d'outils de génomique par des analyses bio-informatiques de la détection et la caractérisation de gènes d'antibiorésistances (ARGs) dans les communautés bactériennes de la mouche soldat noire et ces produits d'élevage. Ce projet vise déterminer si l'utilisation de moulée antibiotique dans l'alimentation des larves pose un risque lié à l'antibiorésistance bactérienne.
Responsabilités
- Réaliser une revue de la littérature sur la biologie des larves de la mouche soldat noire et leur application dans la gestion des déchets.
- Analyser des données de séquençage Illumina NovaSeq 6000 du métagénome bactérien de la larve de mouche soldat noire et du substrat d'élevage pour caractériser les ARGs.
- Identifier des ARGs marqueurs pour le suivi de l'antibiorésistance aux antibiotiques utilisés dans l'alimentation.
- Développer des amorces spécifiques aux ARGs marqueurs pour faire de la PCR quantitative.
- Collaborer à la réalisation de q-PCR des ARGs et à l'analyse des données
- Collaborer avec les membres de l'équipe pour optimiser les processus et atteindre les objectifs du projet.
- Présenter les résultats de la recherche lors de conférences et de séminaires.
Domaines de recherche
- Bio-informatique
- Sciences de l'environnement
- Sciences animales
- Biologie
- Microbiologie
- Entomologie
Directeur de recherche
Antony Vincent
Milieu de recherche
Département des Science Animales de l'Université Laval
Site web
Soutien financier disponible par programme d’études
Maîtrise en sciences animales - avec mémoire
Description du programmeSoutien financier disponible*
Financement en lien avec le projet de recherche
22000$ par année pendant 2 années.
*Cette offre de maîtrise est conditionnelle à l'obtention d'un financement MITACS accélération par la direction de recherche.
Financement en lien avec le programme d'études
Bourses de réussite
| Étapes |
Prime |
| Présentation du projet de recherche ET remise du plan de collaboration |
500$ |
| Dépôt initial du mémoire |
1 000$ |
| Total |
1 500$ |
Financement en lien avec l'Université Laval
* Présentation du soutien financier maximal disponible. Certaines conditions s'appliquent. Sujet à changement sans préavis. Pour plus d'information, renseignez-vous auprès des organismes responsables.
Profil recherché
- Biologie
- Bioinformatique
- Microbiologie
- Environnement et développement durable
Exigences et conditions
Exigences
- Récemment diplômé d'un programme de B.Sc. pertinent (p.ex. bio-informatique, sciences de l'environnement, biologie, entomologie, microbiologie).
- Expérience bio-informatiques et l'environnement R.
- Excellentes aptitudes à la communication et au travail en équipe.
- Capacité à travailler de manière indépendante et à gérer plusieurs tâches simultanément.
- Intérêt pour l'agriculture durable et les pratiques de gestion des déchets.
- Bilangue français/anglais (être capable de comprendre l'anglais écrit et parlé, ainsi que de rédiger en anglais).
Qualifications souhaitées
- Expérience des techniques de biologie moléculaire (par exemple, extraction d'ADN, PCR).
- Bonne compréhension de l'antibiorésistance, des gènes de résistances et de la génétique bactérienne.
- Expérience de la rédaction et de la présentation de documents scientifiques.
Documents exigés
- Lettre de recommandation
- Lettre de motivation
- Curriculum vitæ
- Relevé de notes
Début du programme: janvier 2025
Pour plus d'information
Antony Vincent
Professeur adjoint
Département des sciences animales
Antony.vincent@fsaa.ulaval.ca